Опция "ЭП и шифрование" предназначена для подписания электронного документа в системе «ДЕЛО» аналогично традиционному заверению бумажного документа при помощи подписи и печати. Помимо этого электронная подпись позволяет подтвердить личность автора или отправителя корреспонденции, а также является гарантией того, что в документ после его подписания не были внесены изменения . Данная опция была разработана одновременно с программой «ДЕЛО» по договору на оказание услуг по разработке ПО №2 от 16 января 2006 года. Заказчиками разработки и, соответственно, правообладателями были ООО «Электронные офисные системы (проектирование и внедрение)» и ООО «Электронные офисные системы (софт)». С тех пор опция постоянно развивается. В связи с изменением в законодательстве (N 1-ФЗ "Об электронной цифровой подписи" от 10.01.2002 года утратил силу, 63-ФЗ "Об электронной подписи" от 06.04.2011 - принят) вместо понятия "ЭЦП" появилось понятие "ЭП". Соответственно, было произведено изменение названия опции на "ЭП и шифрование".